dafabet linkPhân lập, định danh vi khuẩn bacillus mycoides bằng trình tự gen 16S rRNA

Cập nhật lúc 09:51, Thứ hai, 21/08/2023(GMT+7)

Kích cỡ font chữ

Bacillus mycoideslà vi khuẩn Gram dương, không có khả năng di động, thuộc nhómBacillus cereus. B. mycoidesđược tìm thấy ở nhiều môi trường khác nhau như trong đất, nước, không khí, cơ thể động vật, và ở một số loài thực vật. Khi phát triển trong đất vi khuẩnB. mycoidescó khả năng thúc đẩy tăng trưởng thực vật, hỗ trợ việc ức chế một số nấm gây bệnh, và tăng năng suất ở cây trồng.B. mycoidesđược bổ sung vào cây trồng có thể tăng cường sản xuất các chất chuyển hóa thứ cấp từ đó làm tăng chiều dài, số lượng của chồi và rễ cây (Ali & cs., 2022; Kurniawan & cs., 2022) Nhiều nghiên cứu cũng đã chỉ ra rằng vi khuẩnB.mycoidescó khả năng thúc đẩy tăng trưởng ở cây ngô (Ali & cs., 2022),Arabidopsis thaliana (Kurniawan & cs., 2022), hoa hướng dương (Ambrosini & cs., 2015), bơ (Guerrero & cs., 2020), củ cải đường (Bargabus & cs., 1997), bầu bí (Michereff & cs.,2002). Cây trồng được xử lý vớiB. mycoidescó hiệu quả quang hợp nâng cao thông qua tích lũy hàm lượng diệp lục và tinh bột cao hơn (Kurniawan & cs.,2022). Một số chủng củaB. mycoidesđược báo cáo là giúp thực vật chống chịu tốt hơn khi bị nhiễm mặn, stress và chống oxy hóa (Ali& cs., 2022). Ngoài ra, protein liên quan đến sinh bệnh dafabet link (PR-1 và PR-2), có khả năng kháng bệnh được tăng cao khi so sánh cây trồng được bổ sung và không bổ sung vi khuẩnB. mycoides(Guerrero & cs., 2020; Kurniawan & cs.,2022).B.mycoidesA1 làm giảm 75% sự phát triển của sợi nấmColletotrichum gloeosporioidesgây bệnh thán thư được phân lập từ quả bơ. Dịch nổiB. mycoidesA1 trong quá trình nuôi cấy làm giảm 41,9% mức độ nghiêm trọng của bệnh thán thư trên quả bơ (Guerrero & cs., 2020).B. mycoidesBM02 được phân lập từ vùng rễ cây cà chua đã tạo ra một loạt các hợp chất có hoạt tính sinh dafabet link bao gồm PAA và MPA để ngăn chặn các bệnh thực vật doFusarium oxysporumf. sp.lycopersici(Fol) và các vi sinh vật gây bệnh khác gây ra (Wu & cs., 2009). Vi khuẩnB. mycoidescó nhiều vai trò đối với cây trồng, tuy nhiên hiện nay còn có rất ít nghiên cứu về vi khuẩn này.

Mục tiêu hướng đến của nghiên cứu này là phân lập vi khuẩnBacillus mycoidestừ đất trồng cây bắp cải tại một số huyện trên địa bàn thành phố Hà Nội và định danh được chủngBacillus mycoidesbằng phương 16S rRNA. Các phương pháp được sử dụng để phân lập vi khuẩnB. mycoidesgồm có: phân lập vi khuẩn, làm thuần khuẩn lạcBacillus mycoides, nuôi lỏng, giữ giống. Kết quả phân lập thể hiện ở Hình 1.

Hình 1. Vi khuẩn B.mycoides trên đĩa nuôi cấy

Nghiên cứu định danh bằng trình tự nucleotide gen 16S rRNA, các phương pháp bao gồm: tách chiết DNA, PCR, điện di, giải trình tự gen, thu thập và xử lý số liệu bằng phần mền BioEdit, MegaX. Nghiên cứu đã định danh bằng hình thái vi khuẩnBacillus mycoidestừ đất trồng cây bắp cải tại huyện Gia Lâm và Sóc Sơn. Kết quả giải trình tự và so sánh mức độ tương đồng nucleotide củaB. mycoidesphân lập và các chủng vi khuẩnB. mycoidesđược công bố trên Genbank đạt c 99,32%. Phân tích cây di truyền phả hệ cho thấy chủngBacillus mycoidestrong nghiên cứu nằm cùng nhánh vơi các chủngBacillus mycoideskhác trên Genbank (Hình 2).